O'Neill ha sido presidente de la Sociedad Aristotélica (1988 a 1989), miembro del Comité de Procedimientos Animales (1990 a 1994), presidente del Nuffield Council on Bioethics (1996 a 1998), miembro y luego presidente interino de Human Comisión Asesora de Genética (1996 a 1999) y miembro del comité selecto de BBC Charter Review. Actualmente es presidenta de la Fundación Nuffield (desde 1997), fideicomisaria de Sense About Science (desde 2002), fideicomisaria de la Fundación Ditchley y fideicomisaria de Gates Cambridge Trust. También se desempeñó como presidenta de la Academia Británica.entre 2005 y 2009. Es miembro del Consejo Asesor de Incentivos para la Salud Global, la ONG formada para desarrollar la propuesta del Fondo de Impacto en la Salud .

En 1999, fue creada como compañera vitalicia como la baronesa O'Neill de Bengarve , de The Braid en el condado de Antrim , y en 2007 fue elegida FRS honoraria . También es Miembro Honorario Extranjero de la Academia Estadounidense de Artes y Ciencias (1993) y la Academia Austriaca de Ciencias (2002), Miembro Extranjero de la Sociedad Filosófica Estadounidense (2003) y Hon. Miembro de la Real Academia Irlandesa (2003), miembro extranjero de la Leopoldina (2004) y de la Academia Noruega de Ciencias (2006) y miembro de la Academia de Ciencias Médicas . Ella es un miembro electo de laHastings Center , una institución independiente de investigación en bioética. En 2004 recibió un título honorario (Doctor en Letras) de la Universidad de Bath . Es miembro distinguida de la Escuela de Estudios Avanzados de la Universidad de Londres, un honor otorgado en 2009.

O'Neill también recibió un Doctorado Honoris Causa de la Universidad Heriot-Watt en 2007 y de Harvard en 2010.

En octubre de 2012, fue nominada como próxima presidenta de la Comisión de Igualdad y Derechos Humanos , y fue confirmada como tal en enero de 2013.

O'Neill fue nombrado miembro de la Orden de los Compañeros de Honor (CH) en los Honores de Año Nuevo 2014 por sus servicios a la filosofía y las políticas públicas.

En 2014 O'Neill fue elegido miembro de la orden alemana Pour le mérite für Wissenschaften und Künste .

En septiembre de 2015, durante el XII. Conferencia internacional quinquenal de Kant en Viena, recibió el prestigioso Kant-Preis de Fritz Thyssen Stiftung por su trabajo académico sobre la filosofía práctica y política de Immanuel Kant. (ver https://kant2015.univie.ac.at/en/about-the-congress/program/social-program/ )

En febrero de 2016, recibió la Cruz de Caballero Comendador de la Orden del Mérito de la República Federal de Alemania por su destacada contribución a las cuestiones morales y éticas de la confianza, la responsabilidad en la vida cívica, la justicia y la virtud.

Actualmente, es la presidenta de la Society for Applied Philosophy , una sociedad fundada en 1982 con el objetivo de promover el estudio y la investigación filosófica que incide directamente en áreas de interés práctico.

En 2017 recibió el premio noruego Holberg por sus destacadas contribuciones a la investigación en artes y humanidades "por su influyente papel en la filosofía ética y política". El mismo año recibió el premio Berggruen .

O'Neill es miembro honorario de Somerville College.