En 1994, Gies recibió la Orden al Mérito de la República Federal de Alemania y la Medalla Wallenberg de la Universidad de Michigan . Al año siguiente, Gies recibió la medalla Yad Vashem Justo entre las Naciones . En 1997, fue nombrada caballero en la Orden de Orange-Nassau por la Reina Beatriz de los Países Bajos . El planeta menor 99949 Miepgies lleva su nombre en su honor. Siempre sostuvo que si bien apreciaba los honores, la avergonzaban: "No soy una heroína. No soy una persona especial. No quiero atención. Hice lo que cualquier persona decente hubiera hecho".

El 30 de julio de 2009, el embajador de Austria en los Países Bajos, Wolfgang Paul, presentó a Gies en su casa la Gran Condecoración de Honor por los servicios prestados a la República de Austria .