Thornton vive en Gospel Oak , al norte de Londres, y está casada con el experto en seguridad en Internet John Carr. Tienen dos hijos adultos.

Ella es Asociada Honoraria de la Sociedad Secular Nacional.

Se informó que reclamaba 22.000 libras esterlinas al año en gastos al decir que el bungalow de su madre en Yorkshire es su casa principal, que ascendía a unas 130.000 libras esterlinas entre 2002 y 2009. Más tarde, Michael Pownall , el secretario del parlamento , la absolvió de cualquier delito. , después de que se determinó que pasaba gran parte de su tiempo allí mientras cuidaba a su madre.